Praca naukowa

Obecnie pracuję na stanowisku asystenta naukowego w Ośrodku Bioinformatyki Małopolskiego Centrum Biotechnologii

Zainteresowania

  • Systemy dynamiczne
  • Dowody wspierane komputerowo
  • Obliczenia numeryczne, symulacja komputerowa
  • Ścisłe całkowanie równań różniczkowych z opóźnieniem
  • Symulacja molekularna
  • Bioinformatyka

Stypendia i projekty

Publikacje

Od najnowszych do starszych

  1. Plesnar, E.; Szczelina, R.; Subczynski, K.W.; Pasenkiewicz-Gierula, M.; Is the cholesterol bilayer domain a barrier to oxygen transport into the eye lens?, Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranes (2018), Vol. 1860, Iss. 2, Pages 434–441, [doi:10.1016/j.bbamem.2017.10.020]

  2. Szczelina, R.; Zgliczyński, P.; Algorithm for rigorous integration of Delay Differential Equations and the computer-assisted proof of periodic orbits in the Mackey-Glass equation, Foundations of Computational Mathematics (2017), accepted - in press, [Open Access, doi:10.1007/s10208-017-9369-5] [arxiv preprint]

    Kod źródłowy dostępny tutaj

  3. Szczelina, R. A computer assisted proof of multiple periodic orbits in some first order non-linear delay differential equation, Electronic Journal of Qualitative Theory of Differential Equations (2016), No. 83, 1-19, [Open Access, doi:10.14232/ejqtde.2016.1.83] [PDF]

    Kod źródłowy dostępny tutaj

  4. Szczelina, R. Murzyn, K. DMG-α-A Computational Geometry Library for Multimolecular Systems, Journal of Chemical Information and Modeling (2014), 54 (11), 3112–3123 [doi:10.1021/ci500273s]

    Praca zrealizowana ramach grantu NCN: 2011/01/N/ST6/07173. [Strona projektu - dokumentacja]

  5. Szczelina, R. Zgliczyński, P. A Homoclinic Orbit in a Planar Singular ODE---A Computer Assisted Proof, SIAM Journal of Applied Dynamical Systems 12 (2013), 1541-–1565 [doi:10.1137/120901271] [preprint (PDF)]

    Kod źródłowy:

    • Z dołączoną biblioteką CAPD v2.0, bez MSYS: [zip]
    • Z dołaczoną biblioteką CAPD v3.0, kompilacja z MSYS: [zip]
    • Wersja dla nowego CAPD v3.0, tylko kod dowodu: [zip]

Konferencje

  1. SocBiN / BIT Bioinformatics, czerwiec 26 - czerwiec 29, 2013 Toruń, Polska

    Poster: Lipid bilayer analysis using 3D Voronoi diagrams [poster w .PDF]

  2. The 10th AIMS Conference on Dynamical Systems, Differential Equations and Applications, lipiec 07 - lipiec 11, 2014 Madryt, Hiszpania

    Tytuł prezentacji (na zaproszenie): Rigorous integration of Delay Differential Equations [slajdy w .PDF]

  3. Kongres BIO 2014, wrzesien 9 - wrzesien 12, 2014 Warszawa, Polska

    Poster: DMG-α: computational geometry package for analysis of molecular dynamic simulations [poster w .PDF]

  4. Short Thematic Program on Delay Differential Equations: Differential equations with variable delay, 04-08 maja, 2015 Fields Institute, Toronto, Kanada

    Tytuł prezentacji (na zaproszenie): Rigorous integration of DDEs and applications

  5. Dynamics, Topology and Computations (DyToComp), 15-20 czerwiec, 2015 IMPAN Centrum Banacha, Będlewo, Polska

    Tytuł prezentacji (na zaproszenie): Rigorous integration of delay differential equations and applications

  6. 10th Colloquium on the Qualitative Theory of Differential Equations, 01–04 Lipiec, 2015 Segedyn, Węgry

    Tytuł prezentacji (na zaproszenie): Constructing Poincaré maps for delay differential equations using rigorous interval arithmetic

  7. 19th IUPAB congress and 11th EBSA congress, 16-20 Lipiec, 2017 Edynburg, Szkocja/Wielka Brytania

    Poster: Computational study of oxygen transport across domains of the membrane of the eye lens fibre cells